[Modding] Rekrutierungsbüro

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Im Grunde könnte ich mir die Antwort hier sehr einfach machen und sagen das zur Erstellung des Spiels die Unity Engine verwendet wurde, womit alles deine Fragen geklärt wären so du dich einmal mit Unity 3D auseinandergesetzt hättest, ich will aber versuchen etwas detaillierter darauf einzugehen.

3D-Polygonmodelle lokalisieren können (...) Welcher Packer

In den sogenannten AssetBundles.
Die Details wurden schon zur genüge am "offiziellen Forum" erörtert, beispielsweise hier.

Welche Shader verfügbar?

Shaders gibt es sowohl built-in (ein paar davon nur bei Unity Pro), als auch als Custom Shader. Wenn du dir also einen schreibst kannst du denn auch verwenden.

Welches Programm zum erstellen?

Solange du es als FBX exportierst hast du so ziemlich die freie Auswahl. Hauptsache du achtest darauf das es Mechanim kompatibel ist. MA/C4D funktioniert natürlich auch.

Der limitierende Faktor dürfte darin bestehen das wenn du dich im rechtlich legalen Rahmen bewegen willst, du eine Unity Pro Lizenz erwerben musst.

Falls eine Antwort nicht zufriedenstellend war, einfach nachfragen!